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Protéomique

La spectrométrie permet de :

  • quantifier une protéine.
  • inventaire des protéines présentes.

Exemples

Identification de

Protéine identifier grâce aux anticorps

  1. Fixation de la protéine d'intérêt en condition qui favorise les interactions avec les protéines associés.
  2. Détachement et analyse protéines associées.

Un groupe (pool) sélectionne les protéines d'intérêt par leur interaction avec

Les principaux problèmes de l'analyse protéique sont que :

  • Le nombre de type de protéines différents.
  • La grande variabilité dans les volumes entre les protéines. Leur quantité peut variée de l'ordre de \(10^6\).
  • Les interactions avec les autres molécules :

    • Les modifications post traductionnelles.
    • Les autres protéines notamment dans le cadre de la formation de complexes protéiques.

Note

Il peut être également intéressant de connaître la localisation des protéines et leur conformation.

  1. Fragmentation et purification.

Définir la question pour adapter le protocole technique (le choix de la chromatographie illustre particulièrement ce fait). Grâce aux différences de propriétés chimique