Protéomique
La spectrométrie permet de :
- quantifier une protéine.
- inventaire des protéines présentes.
Exemples
Identification de
Protéine identifier grâce aux anticorps
- Fixation de la protéine d'intérêt en condition qui favorise les interactions avec les protéines associés.
- Détachement et analyse protéines associées.
Un groupe (pool) sélectionne les protéines d'intérêt par leur interaction avec
Les principaux problèmes de l'analyse protéique sont que :
- Le nombre de type de protéines différents.
- La grande variabilité dans les volumes entre les protéines. Leur quantité peut variée de l'ordre de \(10^6\).
-
Les interactions avec les autres molécules :
- Les modifications post traductionnelles.
- Les autres protéines notamment dans le cadre de la formation de complexes protéiques.
Note
Il peut être également intéressant de connaître la localisation des protéines et leur conformation.
- Fragmentation et purification.
Définir la question pour adapter le protocole technique (le choix de la chromatographie illustre particulièrement ce fait). Grâce aux différences de propriétés chimique