Dénaturer les protéines

Pour dénaturer (déplier) une protéine, il faut utiliser deux types de substances :

• Des agents réducteurs qui suppriment les ponts disulfures (e.g. DTT, beta-mercaptoéthanol).
• Des dénaturants de suppriment les liaisons non covalentes de type hydrogène ou Van der Vaal.

Les dénaturant les plus couramment utilisé sont le SDS et l'urée.

Note

Les ponts disulfures ne sont pas alternés par les dénaturants.

Réduction et alkylation

Il peut être intéressant de linéariser une protéine et d'empêcher la formation de ponts disulfures entre les cystéines. Pour se faire, on a généralement recours à :

• Un réducteur (DTT agent fort qui peut altérer les chaines peptidiques ou TECP agent faible).
• Une substance qui réagit avec les atomes de souffres comme l'iodoacétamide qui provoque une alkylation.