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CAH

La classification ascendante hiéarchique se fait en deux étapes :

  1. Calcul de la matrice des distances.
  2. Application de l'algorithme de classification.

CAH

cah = hclust(mat_distance, method = "complete")

Tableau des méthodes :

Méthode R
Ward ward.D2
centroid
average

$height valeur du criètre d'agglomération.

Afficher le dendrogramme

  • plot(cah) dendrogramme.
  • fviz_dend(cah) library(factoextra) Options :

    • k = nbre nombre de classes à conserver.
    • h = nbre nombre d'individus par groupe.
    • horiz = T mettre le graphique à l'horizontal.

Elaguer l'arbre

cutree(cah, k = 3) élaguer l'arbre.